풀링 유병률 메타분석 R로 하는 방법 mahler83, 2017-09-072017-09-07 Pooled prevalence meta-analysis with R 이미 Systematic review 방식으로 논문을 모아놓은 것을 가정하고. 다음과 같이 csv 파일로 데이터를 정리한다. (data extraction) RStudio에서 우선 meta 패키지를 로딩하고 library(meta) Session –> Set Working Directory로 들어가서 파일이 저장된 경로를 설정해준다. CSV 파일을 읽어들인다. df1 <- read.csv(“meta.csv”, header=T) single proportion data를 분석할 것이므로 metaprop() 함수를 이용한다. meta1 <- metaprop(diseased.n, total.n, sm=”PLN”, data=df1, studlab=paste(study,year), comb.fixed=F) random effect model을 이용할 것이므로 comb.fixed = False로 설정했다. (heterogeneity가 높음. 연구마다 유병률이 꽤 다르고 시대적 특징 등 인구집단에 차이가 있음) logit normalization을 이용하므로 sm=”PLN”으로 설정. 이렇게 하면 meta1에는 메타분석 결과가 정리된다. 논문에 쓸 forest plot도 간단하게 뽑아낼 수 있다. forest(meta1) 보고하는 내용 The pooled prevalence was 23% (95% CI, 11-47%) with high between-study heterogeneity (Q=240, τ^2=0.54, I^2=99%, P<0.01). More reads: A basic introduction to fixed-effect and random-effects models for meta-analysis Package ‘meta’ documentation Meta-analysis of prevalence Share this:FacebookX Science Statistics and Math
Graph and Adjacency Matrix 기초 2014-03-202023-07-19 여러 항목간의 1:1 대결 결과를 바탕으로 전체 순위를 산정하는 방법을 공부하다가 Graph와 Adjacency Matrix라는 개념을 처음 접하게 되었다. 간단하게 정리를 해보자면… 그림처럼 A->B, B->C 이런 Graph인 G1이 있다고 하자. 이를 Adjacency matrix A1으로 변환할 수 있다. 이렇게 만들어진 Adjacency matrix는 재미있는 성질을 가지게 되는데, 바로 n제곱을 하게 되면 n단계를… Share this:FacebookX Read More
Medicine 임신중 운동이 태아 두뇌 발달에 도움 2013-11-132023-07-19 가고 싶었던 학회인 Neuroscience (SfN)에 재미있는 연구 결과가 발표되었나보다. University of Montreal 연구진이 임신중 운동이 태아 두뇌 발달에 미치는 영향을 연구했는데, Socioeconimical status나 기타 건강 관련 습관에 차이가 없는 제3기 (3rd trimester) 임신부 18명을 운동 vs 휴식 그룹으로 나눠 운동 그룹은 일주일에 3회, 20분 이상, 숨이 약간 찰 정도의 운동을… Share this:FacebookX Read More
MERS-CoV 미국 2번째 케이스 2014-05-132014-05-13 일주일 전에 비행기를 타고 미국에 날아든 MERS 케이스가 있었는데, 미국의 두 번째 케이스가 CDC에 의해 확인되었다. 이번에도 역시나 비행기를 타고 사우디아라비아에서 날아든 케이스이다. 두 사람 모두 의료에 종사하는 사람이라고. (healthcare worker) 2012년 말에 사우디에서 발견된 이후로 genome에 돌연변이는 없는 것으로 확인되었다고 한다. 영화나 게임에서는 뭔가 쉽게 돌연변이를 일으켜서 전세계를 감염… Share this:FacebookX Read More