Some useful numbers for plasmid DNA extraction mahler83, 2013-05-012013-11-22 GFP plasmid DNA 뽑으면서 궁금했던 것들을 찾아서 정리해봤다. Optimal Optical Density at 600nm (OD600) for plasmid DNA extraction = 2~4 – This is the log growth phase OD600 = 1 → 1.6 x 10 ^ 9 cells / mL – correlation of cell count and optical density 1 x 10 ^ 8 cells → 500ng DNA – correlation of cell count and estimated DNA yield 그래서! 1.5mg binding capacity를 가진 내가 사용하는 Plasmid DNA extraction kit에서는 OD600 = 2 정도의 대장균 200mL을 사용하면 cell count가 3 x 10 ^ 11이 나오고, Loss를 고려하면 여기서 DNA를 뽑으면 딱 맞을 것 같다. 즉, 너무 뿌옇게 되기 전에 large culture를 끊어주는 것이 좋겠다. Share this:FacebookX Lab Stuff
Academic writing RefWorks Google Docs에 연동해 사용하기 2017-03-232023-07-19 협업을 위한 판을 짜는 중이라 Google Docs에서 RefWorks를 사용하는 것을 시험삼아 해봤다. 1. Add-ons에 들어가 “Get Add-ons …”를 눌러 “refworks”를 검색하면 기능을 추가할 수 있다 2. Add-ons에서 “ProQuest RefWorks”를 활성화시켜주면 우측에 내 레프웍스 계정에 있는 논문들 목록이 뜬다. “Cite this” 버튼을 클릭하면 엔드노트에서 넣는 것처럼 현재 커서 위치에 인용 문구가… Share this:FacebookX Read More
“실온”은 실험용 쥐에게 정상적인 환경이 아닐수도 있다. 2013-11-202023-07-19 흔히 실험용 mouse나 rat을 20~26℃의 “실온”에서 키우게 되는데, 이 온도에서 쥐의 면역반응이 떨어질 수 있다는 연구결과가 나왔다. 30-31도의 따뜻한 온도에서 사육할 경우 tumor formation, growth rate, metastasis 등이 감소했다는 연구. 실험동물 사육 환경의 표준이 흔들릴만한 의미 있는 연구 결과이다. 참고기사: http://www.nature.com/news/chilly-lab-mice-skew-cancer-studies-1.14190 참고논문: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24248371 Share this:FacebookX Read More
Lab Stuff PCR Primer 디자인 방법 2013-12-112018-02-20 PCR Primer Design Guidelines. Primer 짜기 1. 길이는 18-22bp – 너무 짧으면 특이성이 떨어지고 너무 길면 tempalte에 결합하기가 힘들다 2. Tm (Melting Temperature)는 52-58도 – GC content에 의해 Tm값이 결정된다. 너무 높으면 secondary annealing이 될 수 있다. 대개 primer design할 때 값이 주어짐 3. Ta (Annealing Temperature) – Ta… Share this:FacebookX Read More