Nanodrop에서 DNA 측정시 A260/280, A260/230의 의미

absorbance

기본적으로 DNA는 260nm에서 최대 흡광도를 가진다.
가장 많이 쓰이는 지표인 A260/280은 DNA에서 1.8, RNA에서 2.0 이상이면 pure하다고 본다.
A260/230은 2.0-2.2 이상이면 pure하다고 본다.
너무 높으면 기기 오류나 샘플에 문제가 있는 경우이므로 무조건 높다고 좋은 게 아님!

각각의 nucleotide가 가지는 흡광도는 다음과 같다.
A 4.50
T 1.47
G 1.15
C 1.51
(U 4.00)
Thymidine에 비해 Uracil의 흡광도가 높으므로 보통 RNA는 더 높은 흡광도를 가진다.

280nm에서 높은 흡광도를 가지는 contaminant
– Proteins (실제로 280nm 흡광도로 protein quantification도 한다)

230nm에서 높은 흡광도를 가지는 contaminant
– phenols (including TRIzol reagent), Carbohydrates, EDTA

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